Protéin'eXpert, une jeune pousse "bio-tech"
De la protéine recombinante à la protéomique
recombinante
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Le
récent séquençage du génome de différentes
espèces a révélé une importante masse d'informations
génétiques à analyser. La caractérisation
fonctionnelle des protéines issues de ces gènes sera l'un
des atouts majeurs pour la compréhension des mécanismes
moléculaires impliqués dans la régulation des cellules
normales et pathologiques. La production de protéines recombinantes
représente ainsi une activité clé pour la recherche
bio-médicale. Dans ce contexte, deux docteurs de l'Institut de
biologie structurale1
(IBS) ont créé Protein'eXpert, une société
de biotechnologie spécialisée dans la production de protéines
recombinantes. Un transfert de techno-logie est en cours dans le cadre
de la loi sur l'innovation ainsi qu'un contrat de valorisation entre le
CNRS et Protein'eXpert. production
de protéines à façon chez la bactérie E.
coli (étude de faisabilité), puis mise à l'échelle
(20 mg) ;
production
de protéines in vitro dans le système "Rapid Translation
System" RTS (Roche-Diagnostics) dans le cadre d'une collaboration
entre Protein'eXpert et Roche-Diagnostics ;
production
de protéines à haut débit : afin de pouvoir satisfaire
la demande des programmes de génomique structurale, Protein'eXpert
est en train de développer une plate-forme de production automatisée
allant du clonage à la protéine purifiée.
ingénierie
moléculaire : il s'agit de réduire la taille des protéines
par ingénierie informatique puis par ingénierie moléculaire
(biologie moléculaire) à partir des structures cristallographiques
diffractant à faible résolution (3 à 4 Å).
Le principe consiste à déléter les parties mobiles
non essentielles à la fonctionnalité des protéines,
pour augmenter leur compaction et favoriser leur aptitude à cristalliser.
Cette stratégie permet d'obtenir ensuite des cristaux qui diffractent
à haute résolution. La partie ingénierie moléculaire
fait l'objet d'un contrat de valorisation entre le CNRS et Protein'eXpert.
Protein'eXpert, qui n'a pas encore un an d'existence, a déjà
produit une vingtaine de protéines, impliquées dans des
pathologies comme le cancer, le Sida, ainsi que des enzymes pour des
applications biotechnologiques. Ses clients sont des laboratoires de
recherche publique ou privée. Grâce à sa plate-forme
de production de protéines à haut débit, Protein'eXpert
commence à produire ses premières collections de protéines
en format plaque 96 puits (proteotek) et souhaite commercialiser des
proteoteks début 2002. L'ère de la protéomique3
recombinante semble lancée.Adresse
du serveur : http://www.proteinexpert.com
1 CNRS-CEA-Université Grenoble 1. Protein'eXpert est le fruit d'une collaboration entre des chercheurs du Laboratoire de cristallographie macromoléculaire dirigé par Otto Dideberg et des chercheurs du Laboratoire d'ingénierie des macromolécules dirigé par Thierry Vernet. 2 L'effectif de Protein'eXpert est de sept personnes et devrait atteindre une quinzaine de personnes au deuxième semestre 2002. 3 Voir programme "Protéomique et génie des protéines", dans ce numéro de CNRS Info pp. 5-6.
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